便粘液可能由多种原因引起。一般来说，肠道受到刺激或发生炎症等情况时较易出现便粘液。比如，约15% - 20%的肠道炎症性疾病患者会出现便粘液的症状。
肠道炎症因素
肠炎引发： 肠炎是导致便粘液常见原因之一。细菌性肠炎多由食用被细菌污染的食物引起，像大肠杆菌感染肠道后，肠道黏膜会分泌较多黏液，从而导致大便中出现粘液。病毒性肠炎如轮状病毒感染，也会使肠道黏膜受损，出现便粘液现象。炎症性肠病： 比如溃疡性结肠炎，患者肠道会持续发炎，肠道黏膜不断分泌黏液，大便中就会有较多粘液，还可能伴有腹痛、腹泻等症状。克罗恩病也会出现肠道炎症反应，导致大便带粘液。
肠道感染因素
细菌感染： 除了大肠杆菌，沙门氏菌感染肠道后，会引起肠道的炎症反应，使得肠道分泌更多黏液，进而出现便粘液情况。志贺菌感染也会导致肠道黏膜受损，出现便粘液伴有脓血便等症状。寄生虫感染： 例如阿米巴痢疾，是由溶组织阿米巴原虫感染肠道引起的，会导致肠道黏膜坏死、溃疡，大便中出现粘液样物质，还可能有腹痛、腹泻等表现。贾第虫感染肠道后，也会影响肠道正常功能，出现便粘液症状。
其他因素
肠易激综合征： 这是一种常见的功能性肠病，部分患者会出现便粘液情况，通常还伴有腹痛、排便习惯改变等，比如有的患者会腹泻与便秘交替出现，同时大便中有较多粘液。饮食因素： 如果食用了过多辛辣、油腻等刺激性食物，可能会刺激肠道，导致肠道分泌黏液增多，出现便粘液。比如大量食用辣椒后，肠道受到刺激，大便中可能会出现少量粘液。