喷门癌的治疗需综合多种手段，一般来说，手术切除是早期喷门癌的主要治愈性手段，早期喷门癌通过手术治疗，5年生存率可达60%~90%左右。
手术治疗方式
根治性手术： 适用于早期和部分中期喷门癌患者，要切除肿瘤及其周围一定范围的组织，包括胃的一部分、周围淋巴结等。比如远端胃大部切除术，会切除胃的远端部分以及相关淋巴结。姑息性手术： 针对晚期喷门癌出现梗阻等情况的患者，像胃空肠吻合术，能解决进食梗阻问题，让患者能摄入营养，但无法根治肿瘤。
放疗辅助治疗
术前放疗： 可以缩小肿瘤体积，使原本不能手术的患者获得手术机会。一般会在手术前进行2~4周的放疗，剂量通常在40~50Gy左右。术后放疗： 如果手术切除不彻底，或者有淋巴结转移等情况，术后需要进行放疗，进一步杀灭残留的癌细胞，降低复发风险。
化疗参与治疗
术前化疗： 也叫新辅助化疗，能使肿瘤缩小，提高手术切除率，还能消灭潜在的微小转移灶。常用的化疗方案有氟尿嘧啶联合顺铂等方案。术后化疗： 对于术后有高危复发因素的患者，比如淋巴结转移较多等情况，需要进行术后化疗，一般会采用联合化疗方案，巩固手术效果，延长患者生存期。
靶向及免疫治疗
靶向治疗： 针对喷门癌中特定的靶点进行治疗，比如针对人表皮生长因子受体2（HER2）过表达的患者，可以使用曲妥珠单抗等靶向药物，能精准抑制肿瘤细胞生长，但需要进行基因检测来确定是否适合使用。免疫治疗： 通过激活人体自身免疫系统来攻击肿瘤细胞，对于部分喷门癌患者有一定疗效，尤其是在联合化疗等治疗方案时，能提高治疗效果，不过也可能会有免疫相关的不良反应，需要密切监测。