阴茎变黑通常是由于阴茎皮肤色素沉着导致的，其既有生理性原因，也有病理性原因。
一、生理性原因。
1.在男性的生长发育过程中，受到雄性激素的刺激，男性的腋下、乳头、股沟、大腿根部、肛门、阴茎、包皮、阴囊等多处皮肤会出现色素沉着现象，这属于生理性的改变，是正常的情况。不过，具体状况会与人种、基因、生活习惯以及外伤史等因素相关。
二、病理性原因。
1.但要是阴茎局部皮肤突然有新发的色素沉着，或者黑痣出现变大、变形、溃疡、肿物、肉芽肿、菜花样改变、出血等情形时，就需要前往泌尿外科或男科专科进行就诊，以排除性传播疾病、阴茎癌、黑色素瘤等疾病的可能。
总之，当发现阴茎出现变黑等异常情况时，要根据具体表现来判断是生理性还是病理性原因，必要时应及时就医检查，以便明确原因并采取合适的处理措施。