六岁小孩头疼、恶心、肚子疼，可能由以下原因引起：
1.感染：上呼吸道感染、扁桃体炎、肺炎等均可导致发热，从而引起头疼、恶心、肚子疼。
2.胃肠型感冒：多由病毒感染引起，主要表现为胃胀、腹痛、呕吐、腹泻，有时还会伴有发热。
3.急性肠系膜淋巴结炎：多见于7岁以下的小儿，好发于冬春季节，常在急性上呼吸道感染病程中并发，或继发于肠道炎症之后。典型症状为发热、腹痛、呕吐，有时伴腹泻或便秘。
4.脑炎、脑膜炎：常伴有头疼、恶心、呕吐、颈项强直、发烧等症状。
5.阑尾炎：表现为转移性右下腹痛，可伴有恶心、呕吐、发热。
6.肠套叠：多见于两岁以下的儿童，表现为阵发性哭闹、呕吐、果酱样大便，腹部可触及腊肠样肿块。
7.其他：肠痉挛、腹型癫痫、肠梗阻等也可导致类似症状。
如果孩子出现头疼、恶心、肚子疼的症状，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、脑电图、腹部超声等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意让孩子休息，多喝水，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物。