早上起床口臭且舌苔厚厚一层，可能和以下原因有关：
一、不注意口腔卫生：如果平时不注重口腔清洁，卫生工作做得不到位，就容易致使舌苔变厚，口腔出现异味。这种情况一般在认真刷牙之后，症状能够得到一定程度的缓解。
二、口腔溃疡：当患者口腔黏膜受到损伤时，食物残渣容易附着在溃疡表面，进而会在口腔内滋生大量细菌，从而出现口腔发臭、舌苔白腻等表现。对此可在医生指导下使用如口腔溃疡散、冰硼散、桂林西瓜霜等药物进行治疗。
三、消化不良：食物在胃内积聚、发酵会产生强烈异味，有时还会让舌苔出现异常。可遵医嘱服用大山楂丸、健胃消食片、多潘立酮片等药物来改善。
此外，还可能是胃食管反流、慢性胃炎、胆囊炎等疾病引发，应当积极配合医生进行相应治疗。
总结：早上起床口臭和舌苔厚的原因较多，包括不注意口腔卫生、口腔溃疡、消化不良等，也可能与其他疾病相关，需根据具体情况进行处理和治疗。