尿道炎主要是由病原体感染引起的，其中革兰阴性菌较为常见，约占60%~70%。比如大肠埃希菌，就是导致尿道炎的常见病菌之一。
病原体感染因素
细菌感染： 最常见的是大肠埃希菌，它常存在于肠道中，当机体抵抗力下降或尿道黏膜有损伤时，就容易侵入尿道引发感染。另外，金黄色葡萄球菌也可能引起尿道炎，它可以通过血行感染等途径到达尿道部位。支原体、衣原体感染： 解脲支原体、沙眼衣原体是比较常见的致病微生物。性行为是它们传播的主要途径，比如不洁的性行为就容易让支原体、衣原体感染尿道，从而引发尿道炎。病毒感染： 单纯疱疹病毒、腺病毒等也可能导致尿道炎。例如单纯疱疹病毒，可通过性接触传播，感染尿道后会引起一系列炎症反应。
尿道局部因素
尿道梗阻： 像尿道结石、狭窄等情况会引起尿道梗阻。当尿液排出受阻时，尿道内的细菌就容易繁殖，因为尿液无法正常冲刷尿道，使得病原体在局部大量生长，进而引发尿道炎。比如尿道结石患者，结石阻塞尿道，就增加了尿道炎的发病风险。尿道异物： 尿道内放入异物，如尿道导管等，会破坏尿道黏膜的完整性，使细菌容易侵入。而且异物的存在会影响尿液的正常流动，为病原体的滋生创造条件。
机体免疫因素
抵抗力下降： 当人体整体抵抗力下降时，比如患有糖尿病、长期应用免疫抑制剂等情况，身体对病原体的抵御能力减弱，就更容易患上尿道炎。例如糖尿病患者，由于血糖控制不佳，机体的免疫功能受到影响，尿道更容易被病原体侵袭。局部免疫功能异常： 尿道局部的免疫防御机制出现问题时，也容易引发尿道炎。比如尿道黏膜分泌的免疫球蛋白减少等情况，就会使尿道对病原体的抵御能力降低，导致病原体容易在尿道定植而引发炎症。