肠系膜淋巴结炎多由病毒感染引起，一般可对症用药缓解症状。对于病毒感染导致的肠系膜淋巴结炎，通常以对症治疗为主，比如发热时可使用对乙酰氨基酚等退烧药，一般体温超过38.5℃时可考虑使用。
对症治疗药物
退热药物：当患儿体温超过38.5℃且伴有发热不适时，可选用对乙酰氨基酚，适用于3个月以上的儿童；布洛芬也是常用的退热药物，6个月以上儿童可使用。不过，使用退热药物时要注意按照体重或年龄的推荐剂量服用，不能过量。止痛药物：如果患儿有腹痛症状，可在医生评估后使用颠茄片等缓解平滑肌痉挛的药物来减轻疼痛，但要注意儿童使用需谨慎，需严格遵循医嘱。
针对病因的辅助用药
抗病毒药物：如果明确是病毒感染且病情需要，可能会用到一些抗病毒药物，如利巴韦林等，但利巴韦林一般不作为首选，且使用时要注意其适应证和可能的不良反应，儿童使用需谨慎权衡利弊。不过，大多数肠系膜淋巴结炎是自限性的，单纯病毒感染引起的往往不需要常规使用抗病毒药物过度干预。
特殊人群用药注意
儿童患者：儿童使用药物时需格外谨慎，要根据儿童的年龄、体重准确计算用药剂量。比如退热药物对乙酰氨基酚，对于3个月 - 12岁儿童，是按照体重来计算每次的用量，必须严格按照说明书或遵医嘱使用，避免因用药不当对儿童身体造成不良影响。同时，要密切观察儿童用药后的反应，如有无过敏等情况。过敏体质患者：如果患儿本身是过敏体质，在使用上述药物时更要留意。比如使用对乙酰氨基酚或布洛芬时，要询问患儿既往是否有对这些药物的过敏史，一旦出现皮疹、呼吸急促等过敏表现，应立即停药并就医。