反食道反流性食管炎常用的药物主要有质子泵抑制剂、H₂受体拮抗剂和促胃肠动力药等。一般来说，质子泵抑制剂效果较为显著，比如艾司奥美拉唑，能有效抑制胃酸分泌，多数患者用药后症状能较快缓解。
质子泵抑制剂类药物
艾司奥美拉唑： 通过特异性地抑制胃壁细胞质子泵，减少胃酸分泌，从而减轻胃酸对食管黏膜的刺激，一般能在一定时间内改善反流性食管炎的相关症状。通常适用于病情较明显的反流性食管炎患者。兰索拉唑： 同样属于质子泵抑制剂，可抑制胃酸分泌，作用机制是抑制胃酸分泌过程中的关键酶，进而减少胃酸生成，对反流性食管炎引起的烧心、反酸等症状有较好的缓解作用。
H₂受体拮抗剂类药物
雷尼替丁： 能竞争性拮抗组胺H₂受体，减少胃酸分泌，可用于轻至中度反流性食管炎的治疗。不过相对质子泵抑制剂，其抑制胃酸分泌的强度稍弱一些。法莫替丁： 也是H₂受体拮抗剂，通过阻断H₂受体来抑制胃酸分泌，对反流性食管炎导致的不适症状有一定的缓解效果，适用于症状不是特别严重的患者。
促胃肠动力药
多潘立酮： 可以促进胃肠蠕动，加快胃排空，减少胃内容物反流至食管的机会，从而缓解反流性食管炎引起的相关症状。一般适用于有胃肠动力不足情况的反流性食管炎患者。莫沙必利： 能促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道蠕动，改善食管下括约肌功能，有助于减少胃食管反流，对反流性食管炎有一定的治疗作用。