小孩高烧反复发作的原因包括细菌病毒感染、下丘脑损伤以及免疫力低下等。具体如下：
一、细菌、病毒感染
这是极为常见的一种情形。当人体内有细菌、病毒存在并引发身体炎症时，就可能出现小孩高烧反复发作的状况，比如扁桃体炎症、急性喉炎、支气管炎等疾病，这些疾病均会致使小孩高烧反复发作。比如扁桃体炎，细菌或病毒侵袭扁桃体后会引发炎症反应，导致高烧；急性喉炎可能因喉部炎症刺激而使体温反复升高；支气管炎时，炎症的存在也容易导致高烧不退且反复。
二、下丘脑损伤
常见于弥漫性脑损伤情况。一旦小孩下丘脑出现损伤，那么人体的体温调节功能就会出现问题，进而可导致小孩高烧反复发作。当下丘脑受损后，其对体温的调控能力失常，无法正常维持体温的稳定，就容易出现高烧反复的现象。
三、免疫力低下
小孩若是免疫功能发育不完善，就会较难适应外部环境。在对抗入侵身体的有害微生物时，有时退热后温度又会急剧回升，难以将病原菌全部杀灭，这样的情况就有可能导致小孩高烧反复发作。比如小孩自身免疫系统不够强大，在遇到病菌侵袭时，可能初次能退热，但后续又会因病菌未被完全清除而再次发烧。
如果小孩出现高烧反复发作的症状，应尽快就医，严格遵循医嘱进行规范治疗。