苯扎氯铵溶液常用于皮肤、黏膜和小面积伤口的消毒。一般使用时，先根据需要稀释该溶液。比如皮肤消毒时，可将苯扎氯铵溶液用无菌生理盐水或纯化水稀释成0.1%的浓度来擦拭；黏膜消毒则用0.01%的浓度冲洗。
使用前的准备
容器选择： 使用干净、无菌的容器来盛放稀释好的苯扎氯铵溶液。如果是小面积伤口消毒，可准备干净的棉球或纱布。皮肤清洁： 在使用苯扎氯铵溶液之前，要先将需要消毒的皮肤部位清洗干净，去除表面的污垢等，这样能更好地发挥消毒作用。
不同部位的使用方法
皮肤消毒： 用无菌棉球或纱布蘸取适量稀释好的0.1%苯扎氯铵溶液，从伤口中心向外周擦拭，面积要超过伤口周围至少3厘米，一般擦拭2 - 3次即可。例如手部小伤口消毒，就按照这个方法操作。黏膜消毒： 对于黏膜部位，像眼部、阴道等黏膜消毒时，要用0.01%的苯扎氯铵溶液进行冲洗。冲洗时要缓慢轻柔，避免刺激黏膜。比如阴道冲洗，要将稀释好的溶液缓慢注入阴道内，停留几分钟后排出。
注意事项
避免接触眼睛： 如果不小心将苯扎氯铵溶液接触到眼睛，要立即用大量清水冲洗，一般冲洗时间不少于15分钟，然后及时就医。因为该溶液可能会刺激眼睛，引起不适。过敏者禁用： 对苯扎氯铵过敏的人群绝对不能使用该溶液。使用过程中如果出现皮疹、瘙痒、呼吸困难等过敏症状，应立刻停止使用，并寻求医疗帮助。存放要求： 苯扎氯铵溶液要存放于阴凉、干燥处，避免阳光直射，且要放在儿童不易拿到的地方，防止儿童误服。