宫外孕自然流产后是否能流干净，需要根据具体情况来判断。以下是一些需要注意的事项：
1.观察出血情况：宫外孕自然流产后，通常会有阴道流血，但出血量一般不会超过月经量。如果出血量较多、持续时间较长或伴有剧烈腹痛，应及时就医。
2.注意休息：流产后需要休息一段时间，避免过度劳累和剧烈运动，以免影响身体恢复。
3.注意个人卫生：保持外阴清洁，勤换卫生巾，避免感染。
4.定期复查：宫外孕自然流产后，需要定期复查血β-HCG和超声，以了解流产是否完全、是否有盆腔包块等。
5.注意饮食：流产后应注意饮食清淡，避免辛辣、刺激性食物，多吃富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，有助于身体恢复。
6.避免再次宫外孕：宫外孕自然流产后，需要查找导致宫外孕的原因，并进行治疗。同时，在下次怀孕前应进行全面的孕前检查，以降低再次宫外孕的风险。
7.注意避孕：宫外孕自然流产后，卵巢和子宫需要一定的时间恢复，如果在此期间怀孕，容易导致再次宫外孕或其他并发症。因此，需要注意避孕。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果出现异常情况，应及时就医，以便进行针对性治疗。