亚急性甲状腺炎多在病毒感染后1~3周发病，常见表现有甲状腺部位疼痛，疼痛可放射至耳部，疼痛程度不一，有的患者疼痛较剧烈，可伴有全身症状，比如发热，体温一般在38℃左右，也有部分患者体温更高。
甲状腺局部表现
甲状腺肿大： 患者的甲状腺会出现不同程度的肿大，可为单侧肿大，也可为双侧肿大，肿大的甲状腺质地较硬。甲状腺触痛： 用手触摸甲状腺时，能明显感觉到疼痛，尤其是在吞咽动作时，疼痛可能会加重。
全身症状表现
发热情况： 除了前面提到的体温一般在38℃左右外，部分患者发热可持续数周，体温波动不一定，有的患者会出现反复发热的情况。全身不适： 患者会感觉全身乏力，没有精神，还可能伴有肌肉酸痛等症状，影响日常生活和工作。
其他相关表现
甲状腺功能变化： 疾病早期，由于甲状腺滤泡被破坏，甲状腺激素释放进入血液，可能会出现甲亢相关表现，如心慌、手抖、多汗等；随着病情发展，后期可能会出现甲状腺功能减退的表现，如怕冷、嗜睡、食欲减退等。血沉变化： 患者的血沉会明显增快，这也是辅助诊断亚急性甲状腺炎的一个重要指标，一般血沉可超过50mm/h。