怀孕三个月可采取以下方式流产：
一、药物流产加清宫手术：遵医嘱服用米非司酮或米索前列醇等药物，先杀死胚胎并促进子宫收缩，使胚胎和胎盘逐渐排出，之后及时进行清宫手术，将残留物质清除，从而实现流产。
1.米非司酮：可使子宫蜕膜变性坏死、宫颈软化。
2.米索前列醇：能兴奋子宫肌，引起子宫收缩。
二、引产：此时胎儿已逐渐发育长大且有明显骨骼，可采取引产方式流产，较为彻底。引产方法主要有：
1.药物引产，如利凡诺引产。
(1)利凡诺可通过刺激子宫收缩达到引产目的。
2.钳刮术。
此外，流产后1个月内应注意：多休息，可适当活动，但避免剧烈运动；禁止性生活；避免劳累、熬夜等。饮食方面要清淡，避免食用辛辣刺激食物，以免影响恢复。
总结：怀孕三个月流产可选药物流产加清宫或引产，流产后要做好各方面护理和注意饮食。