稽留流产也叫过期流产，指胚胎或胎儿已死亡滞留在宫腔内未能及时自然排出者。导致稽留流产的原因较多，以下是一些主要方面。
染色体异常因素
胚胎自身染色体问题： 大约50% - 60%的稽留流产是由于胚胎自身染色体异常引起的。比如染色体数目异常，像单体、三体、多倍体等情况，会使得胚胎发育异常，最终导致稽留流产。父母染色体异常遗传： 若父母双方有一方存在染色体平衡易位、倒位等结构异常，就有可能遗传给胚胎，从而影响胚胎正常发育，增加稽留流产的发生风险。
母体因素影响
内分泌失调： 女性体内的内分泌激素对妊娠起着重要调节作用。例如黄体功能不全，会导致孕激素分泌不足，无法为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，使得胚胎发育受阻；甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌减少，也会影响胚胎的生长发育，引发稽留流产。一般临床检测发现甲状腺功能异常的女性，稽留流产发生率比正常女性高。全身性疾病： 孕妇患有某些全身性疾病时也易出现稽留流产。比如严重的糖尿病未控制好，高血糖环境会影响胚胎发育；感染风疹病毒、巨细胞病毒等病毒后，也可能导致胚胎停止发育进而引发稽留流产。有研究表明，孕期感染风疹病毒的孕妇，稽留流产发生率可达到一定比例。
子宫因素作用
子宫解剖结构异常： 子宫畸形如单角子宫、双角子宫等，会使子宫腔形态异常，影响胚胎着床和生长空间；子宫肌瘤尤其是黏膜下子宫肌瘤，会占据宫腔空间，阻碍胚胎正常发育，增加稽留流产的发生几率。临床统计显示，有子宫畸形的女性发生稽留流产的概率明显高于子宫正常的女性。宫腔粘连： 宫腔粘连会导致宫腔容积减小，影响胚胎着床和发育，使得胚胎无法正常生长，进而引发稽留流产。
免疫因素相关
自身免疫异常： 孕妇自身存在抗磷脂抗体综合征等自身免疫性疾病时，体内的自身抗体可攻击胎盘组织，影响胎盘的血液循环，导致胚胎缺血缺氧，最终引发稽留流产。据统计，抗磷脂抗体阳性的孕妇发生稽留流产的风险比阴性孕妇高很多。同种免疫异常： 母体对胚胎的免疫排斥反应过强，也可能导致稽留流产。比如母体免疫系统不能正确识别胚胎，将其当作外来异物进行攻击，从而影响胚胎的正常发育。