试管婴儿治疗后也会流产。试管婴儿的孩子和正常怀孕的孩子一样，流产、早产、死产都有可能发生。
一、胚胎质量问题：做试管婴儿后，胚胎的质量是不能完全保障的。因为卵子或者精子可能存在问题，在精卵结合后，会导致胚胎异常。这种异常的胚胎发育到一定程度后，就可能不再继续发育，最终因胚胎停育而引发流产。比如，卵子的质量不佳，可能存在染色体异常等情况；精子如果活力不足或存在畸形等，也会影响胚胎质量。(1)如果卵子的染色体有缺陷，与精子结合后形成的胚胎可能先天不足。(2)精子活力差或有畸形，与卵子结合形成的胚胎也可能不健康。
二、宫颈机能障碍：对于试管婴儿的患者，如果伴有宫颈机能障碍，当胚胎发育到一定程度时，会因为宫口松而导致流产。这可能是由于先天发育不良或后天损伤等原因造成的宫颈机能不全，使得宫颈无法有效维持妊娠。(1)先天因素可能导致宫颈结构异常，不能很好地支撑胚胎发育。(2)后天如多次分娩、刮宫等操作也可能损伤宫颈机能。
三、其他疾病因素：还有一些其他的疾病也可能导致试管婴儿流产。例如自身免疫性疾病、内分泌紊乱等。自身免疫性疾病可能会攻击胚胎，影响其正常发育；内分泌紊乱会使体内激素水平失衡，不利于胚胎的生长和维持。(1)像系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病会干扰妊娠。(2)甲状腺功能异常等内分泌问题会影响胚胎的稳定。
总之，试管婴儿治疗后并非就万无一失，仍然存在流产等风险，需要密切关注和精心护理。