3个月宝宝大便绿色，其原因可能包括饮食不当、过度饥饿、受凉、乳糖不耐受以及感染等。建议咨询专业医生以进行妥善处理。具体原因如下：
一、饮食不当：
1.母乳喂养期间，若母亲服用补铁剂、进食大量酸性食物或富含铁的食物如猪血等，会致使宝宝大便呈绿色。对于奶粉喂养的宝宝，奶粉中含较多矿物质成分，宝宝不能完全吸收时也会导致大便变绿。这些情况一般无需特殊处理。
二、过度饥饿：若喂养不及时，宝宝过度饥饿，肠道蠕动会加快，肝脏分泌的胆绿素增多从而对大便染色使其呈绿色。此时家长应调整喂奶时间，避免宝宝过度饥饿。
三、受凉：3个月宝宝胃肠功能较为脆弱，若受到寒冷刺激，比如腹部着凉，就会出现大便颜色发绿的情况。要注意给宝宝腹部做好保暖措施。
四、乳糖不耐受：宝宝乳糖不耐受时，母乳及含乳糖食物喂养会使大便偏绿、偏稀甚至呈水样便。此时需要给宝宝使用深度水解奶粉，避免宝宝摄入乳糖而引发相关症状。
五、感染：少数宝宝因金黄色葡萄球菌感染引起肠炎，会导致大便偏绿色。此时一般以对症治疗为主，可遵医嘱使用头孢克洛干混悬剂、阿莫西林颗粒等药物进行治疗，也可服用乳酸菌素片、胃蛋白酶等来调节肠道菌群。
注意事项：平时要注意宝宝的饮食，避免进食或喂奶过多，同时要注意饮食卫生。建议妈妈多吃蔬菜、水果，禁食生冷、辛辣、刺激食物。平时要注意保暖，防止宝宝受凉，还可以轻柔地给宝宝按摩腹部，以促进胃肠消化。
总之，当发现3个月宝宝大便绿色时，应综合考虑各种可能的原因，并根据具体情况采取相应的措施。若有疑问或异常情况持续，应及时咨询专业医生。