乙肝病毒难以彻底清除的原因主要有以下几点：
1.乙肝病毒的cccDNA难以完全清除：cccDNA是乙肝病毒的原始模板，存在于肝细胞的细胞核中，很难被药物彻底清除。
2.乙肝病毒的变异：乙肝病毒容易发生变异，使得现有的抗病毒药物无法有效抑制病毒的复制。
3.免疫耐受：部分乙肝病毒感染者对乙肝病毒产生免疫耐受，使得免疫系统无法识别和清除病毒。
4.治疗不规范：乙肝治疗需要长期坚持，若患者不规范治疗，如擅自停药、减量等，容易导致病毒耐药，影响治疗效果。
针对乙肝病毒难以彻底清除的问题，目前主要采取以下方法进行治疗：
1.抗病毒治疗：使用核苷类似物或干扰素等药物抑制病毒复制。
2.免疫调节治疗：通过调节免疫系统，增强对乙肝病毒的清除能力。
3.保肝治疗：使用护肝药物，减轻肝脏炎症和损伤。
4.预防和治疗并发症：对于乙肝患者，还需要预防和治疗肝硬化、肝癌等并发症。
为了预防乙肝病毒的感染和传播，可以采取以下措施：
1.接种乙肝疫苗：这是预防乙肝最有效的方法。
2.避免高危行为：如不共用注射器、不与他人共用牙刷、剃须刀等。
3.注意个人卫生：保持皮肤、黏膜的完整性，避免接触乙肝患者的血液、体液。
4.避免母婴传播：乙肝病毒携带者的母亲在分娩时应采取措施，避免新生儿感染乙肝病毒。