慢性萎缩性胃窦炎主要通过以下方式进行治疗：
一、一般治疗：患者胃部黏膜存在糜烂，平时生活中应多吃富含维生素和蛋白质的食物，少食多餐，注重饮食清洁。
二、药物治疗：
1.若因幽门螺杆菌感染导致，通常会出现嗳气、反酸、食欲下降、咯血等症状。可遵医嘱口服抗幽门螺杆菌药物，如奥美拉唑肠溶胶囊、阿莫西林胶囊等。
2.因存在胃黏膜糜烂，还可遵医嘱口服保护胃黏膜的药物，如胶态次枸橼酸铋、复方铝酸铋片等。
三、手术治疗：对于胃黏膜糜烂严重的患者，可通过手术治疗，包括内镜黏膜下剥离术、内镜下激光手术等。
在日常生活中，需注意饮食规律，一日三餐定时定量。多食用小米粥、蔬菜汤等食物，可减轻胃肠道负担。同时，要养成良好的饮食习惯和生活方式，避免过度劳累和精神紧张，有助于病情的恢复和预防疾病的复发。
总之，对于慢性萎缩性胃窦炎，要根据具体病情选择合适的治疗方法，并注意日常生活的调养。