三岁宝宝发烧39摄氏度最快的退烧方式是结合药物治疗和物理降温。
一、物理降温：
1.宝宝发热时，可以用温水毛巾敷在前额。
2.若存在手脚冰凉现象，可同时适当用温水泡手脚。
3.发热期间要多给宝宝喝水，以加速体内散热。
4.必要时还可以给宝宝泡个澡。
二、药物治疗：
1.宝宝出现高热现象需结合退烧药进行退热治疗，比如使用布洛芬混悬液或对乙酰氨基酚栓等。
2.同时还需要查明具体的发热病因，选择对因药物治疗。如果是细菌感染，可适当使用抗生素类药物，如头孢唑肟或阿莫西林等；如果是病毒感染，可适当使用抗病毒药物，如抗病毒滴丸或抗病毒口服液等。
总之，对于三岁宝宝发烧39摄氏度的情况，要综合运用物理降温和药物治疗来帮助其尽快退烧，并且要明确病因进行针对性治疗。