亚急性甲状腺炎的治疗方法需根据病情来定，一般可通过药物缓解症状等。
药物治疗方面
非甾体抗炎药：常用的有阿司匹林，它能减轻炎症和疼痛，一般可以缓解轻至中度的疼痛和发热等症状。还有布洛芬，也能起到抗炎、止痛的作用，帮助缓解亚急性甲状腺炎引起的不适。糖皮质激素：对于症状较重的患者，如疼痛明显、体温持续较高等情况，可能会使用泼尼松等糖皮质激素。它能快速减轻炎症反应，但使用时需要在医生的严格指导下，因为要注意药物的剂量和疗程等问题。
对症治疗情况
针对甲状腺功能亢进期：如果出现甲状腺功能亢进相关表现，如心悸等，一般不需要抗甲状腺药物治疗，通常是暂时性的，随着病情发展会自行缓解。针对甲状腺功能减退期：若发生短暂性甲状腺功能减退且症状明显，可适当补充甲状腺激素，如左甲状腺素钠片，但一般是短期应用，随着甲状腺功能恢复，大多可以停用。
一般注意事项
休息很重要：患者需要多休息，让身体有足够的能量来对抗疾病，一般建议保证每天有7~8小时的充足睡眠，避免过度劳累。饮食方面：要注意营养均衡，适当增加蛋白质的摄入，如瘦肉、鸡蛋等，同时多吃蔬菜水果，保证维生素的充足供应。避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、咖啡等，以免加重不适。