尿道炎主要是由病原体感染引起的，常见的病原体有大肠杆菌等，大约50%的尿道炎是由大肠杆菌导致的。
病原体感染因素
细菌感染： 最常见的是大肠埃希菌，它常通过尿道逆行侵入引发感染。比如女性尿道短且直，更易被细菌侵袭。还有葡萄球菌等也可能引起尿道炎。支原体、衣原体感染： 性传播是支原体、衣原体感染尿道炎的主要途径。如果有不安全的性行为，就容易感染支原体或衣原体从而引发尿道炎。
尿道局部因素
尿道梗阻： 像尿道结石、狭窄等情况会导致尿液排出不畅，尿液在尿道内残留，为细菌滋生提供了良好环境，进而引发尿道炎。例如尿道结石患者，结石阻碍尿液流通，就增加了患尿道炎的风险。尿道损伤： 外界暴力撞击、器械检查等导致尿道损伤，这会使尿道黏膜防御功能受损，细菌容易入侵引发炎症。比如做尿道镜检查时操作不当可能造成尿道损伤，之后就可能引发尿道炎。
机体免疫力低下
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖升高，身体抵抗力下降，白细胞的吞噬功能减弱，容易受到病原体侵袭，更容易患上尿道炎，而且一旦发生尿道炎，病情往往较难控制，容易反复发作。长期使用免疫抑制剂者： 比如器官移植后长期服用免疫抑制剂的患者，机体免疫力处于较低水平，病原体容易趁虚而入引发尿道炎。