怀孕初期孕酮低的原因包括黄体功能不足、甲状腺功能失调以及生理性因素。具体如下：
一、黄体功能不足。当黄体功能出现异常时，会导致孕酮值降低，甚至在25ng/ml以下。此时需要到医院检查，明确究竟是内分泌疾病、胚胎染色体异常还是其他原因造成的，以便进一步采取治疗措施。
1.内分泌疾病可能影响黄体功能，进而使孕酮降低。
2.胚胎染色体异常也可能与孕酮低相关。
二、甲状腺功能失调。如果孕妇甲状腺功能失调，体内会出现胰岛素抗体，从而引起孕酮降低。
三、生理性因素。孕酮作为一种释放性激素，在不同时间测量其数值可能有较大变化。
针对怀孕初期孕酮低的治疗方法如下：
一、生活方面。可以多吃富含维生素、豆类和果胶类的食物，饮食以清淡为主，多补充叶酸，调节体内分泌；注意休息，每天坚持适当走动，活动身体，避免性行为；保持心情舒畅，不要过度忧郁。
二、药物治疗。可以服用黄体酮胶囊药物，或通过肌肉注射来及时补充黄体酮，以调整孕酮过低的情况。如果情况过于严重，要根据医生建议进行保胎治疗，最好卧床休息，避免各种剧烈活动。具体用药需按照医师嘱托。
总之，怀孕初期孕酮低可能由多种原因引起，需要根据具体情况进行相应的检查和治疗，同时在生活中也要注意各方面的调理。