流感病毒不是冠状病毒。流感病毒属于正粘病毒科，而冠状病毒属于冠状病毒科。流感病毒一般呈球形或丝状，直径80~120纳米，新分离株则多呈丝状，长度可达4000纳米；冠状病毒多呈球形，直径约80~120纳米，基因组为线性单股正链RNA。
病毒的形态结构差异
流感病毒形态： 流感病毒有包膜，包膜上有血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）两种糖蛋白刺突，病毒内部有螺旋形核衣壳。冠状病毒形态： 冠状病毒的包膜上有花瓣状的棘突，形似皇冠，其基因组是所有RNA病毒中最大的，约27~32kb。
病毒的基因组区别
流感病毒基因组： 流感病毒基因组由8个节段的负链RNA组成，分别编码不同的蛋白，如聚合酶蛋白、核蛋白等。冠状病毒基因组： 冠状病毒基因组是一条单股正链RNA，具有5’端甲基化帽子和3’端poly（A）尾结构，可直接作为信使RNA翻译蛋白。
引发疾病的特点不同
流感病毒引发疾病： 流感病毒感染人体后，常引起流行性感冒，起病急，患者会出现高热（体温可达39~40℃）、头痛、肌痛、乏力等全身症状，呼吸道症状相对较轻，但也可导致肺炎等严重并发症，在冬春季高发。冠状病毒引发疾病： 部分冠状病毒感染可引起呼吸系统疾病，例如2003年的严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）引发重症急性呼吸综合征，患者主要表现为发热、干咳、乏力等，严重者可出现急性呼吸窘迫综合征；2019新型冠状病毒（SARS-CoV-2）引发新冠肺炎，症状轻重不一，有的患者以发热、干咳、乏力为主要表现，有的则出现呼吸困难等严重症状，不同毒株引发疾病的严重程度等也有差异。