16岁有性生活可能会导致月经不调，但也可能是其他原因引起。以下是一些可能的情况：
1.内分泌失调：16岁女生的生殖系统和内分泌系统尚未完全发育成熟，性生活可能会对其产生影响。如果性生活时精神紧张、焦虑或受到惊吓，可能会导致内分泌失调，从而引起月经不调。此外，长期熬夜、过度节食、精神压力过大等因素也可能导致内分泌紊乱，进而出现月经不调的症状。
2.怀孕：如果性生活时没有采取有效的避孕措施，可能会导致怀孕。怀孕后，卵巢会停止排卵，子宫内膜也不会再脱落，从而出现停经的现象。因此，16岁女生如果出现月经推迟的情况，需要及时进行验孕，以排除怀孕的可能。
3.其他妇科疾病：除了上述情况外，一些妇科疾病也可能导致月经不调，如多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症、子宫肌瘤等。这些疾病可能与性生活无关，而是由于其他因素引起的。
需要注意的是，16岁女生的生殖系统和身体尚未完全发育成熟，性生活可能会对其健康产生一定的影响。此外，过早开始性生活还可能增加感染性传播疾病的风险。因此，建议16岁的女生避免过早开始性生活，并注意保护自己的身体健康。如果出现月经不调等异常情况，应及时就医，以便明确病因并进行针对性的治疗。