男生生殖器上长小痘痘可能由多种原因引起。比如珍珠状阴茎丘疹，这是一种良性病变，多见于20 - 40岁左右的男性，表现为阴茎冠状沟处环绕排列的珍珠状、半透明小丘疹，一般无自觉症状，不需要特殊治疗。
二、包皮龟头炎导致
感染性包皮龟头炎： 多由细菌、真菌等病原体感染引起。例如白色念珠菌感染，会出现阴茎包皮和龟头红斑、小丘疹，伴有瘙痒、灼热感。如果是细菌感染，可能有局部红肿、疼痛等表现，严重时会有脓性分泌物。非感染性包皮龟头炎： 常因局部刺激引起，像包皮过长导致包皮垢堆积，长期刺激就容易引发炎症，出现小痘痘样的皮疹，同时可能有局部的瘙痒、不适等症状。
三、尖锐湿疣引起
传播途径： 主要通过性接触传播。一般在感染人乳头瘤病毒（HPV）后，经过1 - 8个月，平均3个月的潜伏期，生殖器部位会出现淡红色小丘疹，逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状等外观。这种情况需要及时就医治疗，因为具有传染性，且可能反复发作。
四、阴囊湿疹导致
症状表现： 阴囊部位可出现小痘痘样皮疹，同时伴有阴囊皮肤瘙痒、红肿、渗出等表现，搔抓后可能加重症状。其发生可能与局部潮湿、过敏等因素有关，比如穿紧身不透气的内裤，或者对某些物质过敏等。