儿童尿道炎反复发作的根治方法主要包括对因治疗和辅助治疗。建议在医生指导下积极治疗，坚持足量、足疗程用药，避免不合理用药导致病情延误。
一、对因治疗：
1.淋菌性尿道炎：淋球菌是引发尿道感染的重要致病菌，常合并累及生殖系统黏膜。对于淋菌性尿道炎感染，主要的治疗药物有：
(1)青霉素药物，如氨苄西林胶囊、哌拉西林钠他唑巴坦钠等；
(2)抗生素药物，如头孢曲松钠、头孢氨苄胶囊等。对于病情严重或合并生殖系统感染的儿童，需在医生评估下适当延长药物使用疗程。
2.非淋菌性尿道炎：非淋菌性尿道炎是指由淋球菌以外的病原体感染所致。感染后可使用的药物有：
(1)红霉素肠溶片、阿奇霉素片等抗生素；
(2)对于复发的非淋菌性尿道炎，可选择甲硝唑片、替硝唑片等药物进行治疗。
二、辅助治疗：对于患有尿道炎的儿童，应多喝水以增加尿量，对尿道中的病菌起到冲洗作用。同时要注意保持私处卫生，内裤每天换洗，勤洗手，以去除尿道炎的各种诱因，防止复发。
总之，通过对因治疗结合辅助治疗，有助于根治儿童反复发作的尿道炎。但具体的治疗方案应严格遵循医生的指导。