喝酸奶的最佳时间通常为饭后30分钟到2个小时之间。
首先，饭后30分钟到2个小时之间，人的胃液被稀释，pH值会上升到3~5，此时喝酸奶，其中的乳酸菌非常活跃，能够促进肠胃蠕动和消化液的分泌，从而有利于食物的消化吸收。其次，晚上喝酸奶好处更多。因为晚间12点至凌晨是人体血钙含量最低的时候，有利于食物中钙的吸收。同时，这一时间段中人体内影响钙吸收的因素也比较少，虽然酸奶中含有乳酸，但是它能促进钙的吸收。所以，可以在晚上睡前喝一杯酸奶，这样既能补充营养，又能促进钙的吸收。
需要注意的是，酸奶不能空腹喝，因为空腹喝酸奶可能会刺激胃肠道排空，酸奶中的营养来不及彻底消化吸收就被排出，饭后喝则可减少刺激，让酸奶在胃中被慢慢吸收。此外，酸奶中的某些菌种及酸性物质对牙齿有一定的损害，喝完后应及时刷牙或漱口。