扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的皮肤良性赘生物，治疗方法有多种，其中药物治疗是常见方式之一。常用的药物如维A酸类药物，可调节细胞分化，但使用时要注意避免用于皮肤破损处。一般来说，治疗扁平疣没有绝对的“最好”方法，需根据个体情况选择。
药物治疗方面
外用药物： 有维A酸软膏，它能改善细胞的异常分化，对扁平疣有一定治疗作用，但可能会引起局部刺激，如发红、脱屑等。还有5%的咪喹莫特乳膏，它属于免疫调节剂，通过刺激机体的免疫反应来发挥作用，但使用后可能出现局部红斑、水肿等不良反应。内服药物： 对于病情较严重或外用药物效果不佳的情况，可考虑内服免疫调节剂，如转移因子口服液，它能调节机体免疫功能，但起效相对较慢。
物理治疗手段
冷冻治疗： 是利用低温使疣体坏死脱落。一般冷冻后局部会出现水疱，然后结痂脱落，这个过程大概需要1 - 2周。冷冻治疗适用于数目较少的扁平疣，但可能会有疼痛，且部分人可能需要多次治疗才能完全去除疣体。激光治疗： 利用激光的高能量瞬间破坏疣体。治疗时会有轻微疼痛，术后要注意保持创面清洁，避免感染，一般1周左右创面可愈合。激光治疗对于较大或较厚的疣体效果较好，但也存在留疤的风险，尤其是瘢痕体质的人要谨慎选择。
自我护理注意事项
避免搔抓： 扁平疣具有传染性，搔抓会导致病毒接种到正常皮肤，引起新的皮疹出现。所以要尽量克制自己，不要用手去抓挠患处。注意个人卫生： 要保持皮肤清洁，个人的毛巾、脸盆等物品要单独使用，避免与他人共用，防止交叉感染。同时，要注意增强自身免疫力，规律作息，保证充足睡眠，适当进行体育锻炼，如每天散步30分钟左右，有助于身体的恢复。