一侧睾丸隐隐作痛可能由多种原因引起，比如附睾炎，附睾炎多由细菌感染导致，急性期可能有阴囊部位红、肿、热、痛，慢性期就可能出现隐隐作痛，病程可能持续数周甚至更久。
附睾炎相关情况
感染因素导致附睾炎： 大肠杆菌等常见细菌可引起附睾炎，细菌从尿道、前列腺等部位逆行感染到附睾。比如有过尿道操作史的人，就更容易让细菌有可乘之机引发附睾炎。非感染因素相关： 自身免疫性疾病也可能累及附睾，引发隐隐作痛的情况，不过这种相对较少见。
精索静脉曲张引起
精索静脉曲张原理： 精索内静脉回流受阻，导致静脉丛扩张、迂曲。一般青少年更容易出现，轻度精索静脉曲张可能没有明显症状，中度或重度时可能会感觉一侧睾丸隐隐作痛，尤其在长时间站立、行走后症状可能加重。
睾丸扭转情况
睾丸扭转特点： 多发生在青少年，是比较凶险的情况。通常是在睡眠中或者剧烈运动后突然出现一侧睾丸剧烈疼痛，但也有部分人会表现为隐隐作痛，不过往往同时伴有阴囊红肿等表现，而且病情进展较快，如果不及时处理可能会导致睾丸坏死。发病机制： 睾丸和精索的位置发生异常扭转，阻断了睾丸的血液供应，从而引起一系列症状。
慢性前列腺炎影响
前列腺炎与睾丸痛关系： 慢性前列腺炎患者可能会出现一侧或双侧睾丸隐隐作痛的情况，同时还可能伴有尿频、尿急、尿不尽等排尿异常症状，以及会阴部坠胀不适等表现。前列腺炎的发生与细菌感染、不良生活习惯等多种因素有关，比如长期久坐、憋尿等都可能增加前列腺炎的发病风险，进而影响到睾丸出现隐隐作痛的情况。