慢性粒细胞白血病的治疗目前靶向药物是主要手段，其中伊马替尼是常用的一线治疗药物，约90%的慢性粒细胞白血病患者服用伊马替尼后能获得较好的疗效，5年生存率可达到85%~90%。
靶向药物治疗
伊马替尼： 是慢性粒细胞白血病的经典靶向药物，能特异性阻断ATP在ABL激酶上的结合位置，抑制酪氨酸激酶的活性，从而抑制白血病细胞的增殖。一般需要长期服用。尼洛替尼： 属于二代酪氨酸激酶抑制剂，对于伊马替尼耐药或不耐受的患者可以考虑使用，它对某些突变型的激酶有更好的抑制作用。
化疗药物治疗
羟基脲： 可以用于慢性粒细胞白血病慢性期的降细胞治疗，能暂时降低白细胞数量，但不能从根本上治愈疾病，通常作为辅助治疗或不能使用靶向药物时的替代方案。一般每天剂量根据患者情况调整。白消安： 也可用于慢性粒细胞白血病的治疗，不过现在应用相对较少，因为靶向药物的效果更好且副作用相对更易控制。
造血干细胞移植治疗
异基因造血干细胞移植： 是有可能治愈慢性粒细胞白血病的方法，适用于年轻、有合适供体的患者。但移植存在一定风险，如移植相关的感染、移植物抗宿主病等，移植后的并发症发生率约为30%~50%。一般适合在慢性期且有合适供体的患者考虑。自体造血干细胞移植： 相对异基因移植风险较低，但复发率可能较高，一般用于某些特定情况的患者。