肾结石的治疗方法需根据结石大小、位置等情况选择，一般来说，直径小于0.6厘米的肾结石，约有50%可通过保守治疗自行排出。
药物治疗方面
利尿剂： 如氢氯噻嗪等，可增加尿液排出，帮助小结石排出，但长期使用需注意电解质紊乱等问题。溶石药物： 对于尿酸结石，可使用枸橼酸氢钾钠等药物，通过碱化尿液来促进尿酸结石溶解，但起效相对较慢，一般需要数周甚至数月时间。
手术治疗情况
体外冲击波碎石： 适用于直径在2厘米以下的肾结石。利用冲击波聚焦后击碎结石，使其随尿液排出体外。一般单次治疗费用大概在1000~3000元左右，多数患者经过1~2次治疗可将结石击碎排出，但对于一些质地坚硬的结石可能效果不佳。经皮肾镜碎石取石术： 适用于较大的肾结石，如直径大于2厘米的结石。通过在腰部建立通道，进入肾脏，用器械将结石取出或击碎取出。手术费用相对较高，大概在1万~2万元左右，术后恢复时间一般需要1~2周，但能较彻底地清除较大的结石。
生活方式调整
增加饮水量： 每天饮水量要达到2000~3000毫升以上，这样能增加尿量，促进小结石排出，还能稀释尿液，减少结石形成的机会。比如可以定时定量喝水，每隔1~2小时喝100~200毫升水。饮食控制： 限制草酸含量高的食物摄入，像菠菜、坚果、巧克力等要少吃；嘌呤高的食物如动物内脏、海鲜也要限制；同时要减少高钙食物的过量摄入，不过也不能过度低钙饮食，因为低钙饮食可能会增加尿草酸排泄。