眼部扁平疣的去除方法主要有物理治疗、药物治疗以及手术治疗。
一、物理治疗：眼部扁平疣一般是由HPV感染导致的，这是常见的病毒性皮肤病，可通过直接或间接接触进行传播。采用激光或者冷冻等物理手段，能够将皮损剥脱，进而实现去除的目的。具体来说，激光治疗利用激光的能量精准地作用于扁平疣病变部位，使其迅速被破坏和去除；冷冻治疗则是通过低温使扁平疣组织坏死脱落。
二、药物治疗：要依据医生的指导来使用水杨酸软膏或者维A酸乳膏、他扎罗汀凝胶等药物。水杨酸软膏能帮助软化和剥脱角质，促进扁平疣的消退；维A酸乳膏和他扎罗汀凝胶可调节皮肤细胞的生长和分化，对扁平疣有一定的治疗效果。
三、手术治疗：如果病情较为严重，可采取手术切除的方式进行治疗，以达到治愈效果。
在治疗期间，务必注意眼部的清洁和卫生，防止出现继发感染的情况，同时要按照规定定期到医院进行复查。
总之，对于眼部扁平疣的去除，可根据具体情况选择合适的治疗方法，并且要注重治疗过程中的护理和观察。