常吃奥美拉唑可能会带来一些副作用。一般来说，长期服用奥美拉唑可能出现的副作用包括：胃肠道方面，可能引起恶心、呕吐、腹胀等不适，有研究发现约1% - 3%的人会出现这类胃肠道反应；营养吸收方面，长期使用可能影响维生素B12的吸收，不过通常需要较长时间（比如连续使用1年以上）才会比较明显；骨骼方面，长期服用可能增加骨折风险，尤其是老年患者长期使用时需留意；感染方面，可能使胃肠道感染的风险略有增加，比如幽门螺杆菌感染相关的情况可能受影响。
胃肠道相关副作用
胃肠道不适反应： 部分人常吃奥美拉唑后会出现恶心、呕吐的情况，还有些人会感觉腹胀。比如有些长期服用奥美拉唑治疗胃溃疡的患者，约有1% - 3%会出现不同程度的恶心、呕吐症状，这是因为奥美拉唑对胃肠道的蠕动和消化功能有一定影响。影响营养吸收： 长期吃奥美拉唑可能会影响维生素B12的吸收。维生素B12对神经系统等有重要作用，长期缺乏可能会出现一些神经系统相关的症状，不过这种情况通常是在连续使用奥美拉唑1年以上才比较容易出现。
骨骼方面的影响
增加骨折风险： 对于老年人群来说，常吃奥美拉唑可能会增加骨折的风险。有研究表明，长期服用奥美拉唑的老年患者，发生髋骨、腕骨、脊柱骨折的可能性比一般人要高一些。这是因为奥美拉唑可能影响钙的代谢等，进而对骨骼健康产生不利影响。
感染相关副作用
增加胃肠道感染风险： 常吃奥美拉唑可能会使胃肠道感染的风险略有上升。比如可能会影响胃肠道的正常菌群平衡，让一些有害菌更容易滋生，从而增加像胃肠道细菌感染等情况的发生几率。不过这种情况一般不是特别普遍，但长期服用者还是需要留意自身胃肠道的感染症状，如出现腹痛、腹泻伴有发热等情况要及时就医。