三个月大婴儿喉咙有痰但没其他症状，可能是以下原因引起：
1.喉软骨发育不完善：婴儿的喉部组织比较柔软，喉软骨发育不完善，吸气时，喉部组织会下陷，导致喉腔变窄，出现呼噜呼噜的声音，这是一种正常的生理现象，一般在孩子长大一些后会逐渐改善。
2.呼吸道感染：如果孩子的喉咙有痰，同时还伴有咳嗽、流鼻涕等症状，可能是呼吸道感染引起的。这种情况下，需要及时就医，医生会根据孩子的具体情况给予相应的治疗。
3.过敏：如果孩子对某些物质过敏，也可能会导致喉咙有痰。常见的过敏原包括花粉、尘螨、动物毛发等。如果怀疑孩子过敏，可以带孩子去医院进行过敏原检测，以便及时采取相应的措施。
4.胃食管反流：如果孩子在吃奶或睡觉时，喉咙有痰的症状比较明显，可能是胃食管反流引起的。这种情况下，需要调整孩子的喂奶或进食方式，喂奶后及时拍嗝，睡觉时将头部垫高。
针对以上情况，可以采取以下措施：
1.给孩子多喝一些水，有助于稀释痰液，促进痰液排出。
2.保持室内空气湿润，可以使用加湿器增加空气湿度。
3.给孩子拍背，有助于促进痰液排出。具体方法是：将孩子竖着抱起，空心掌由下向上、由外向内轻轻拍打孩子的背部，每次拍背5-10分钟，每天拍2-3次。
4.如果孩子的症状比较严重，或者持续时间较长，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，三个月大的婴儿身体比较娇嫩，在处理孩子的喉咙有痰问题时，要注意以下几点：
1.不要给孩子滥用药物，尤其是抗生素。如果孩子的症状不是很严重，建议先观察一段时间，看看症状是否会自行缓解。
2.给孩子喂奶时，要注意控制奶量和喂奶速度，避免孩子呛奶。
3.注意孩子的保暖，避免着凉。
4.不要让孩子接触过敏原，如花粉、尘螨等。
5.如果孩子有其他异常症状，如呼吸急促、咳嗽加重、发热等，应及时就医。