胃肠功能紊乱是否能自愈需依病情判断。轻度的通常可自愈，但若因胃炎、胃溃疡等病理原因致胃肠功能紊乱则一般难自愈。
一、因经常熬夜、饮食不良致症状较轻的胃肠功能紊乱，无需特殊治疗，通过改善不良习惯可慢慢自愈。比如，患者应调整作息，避免熬夜；在饮食上，要保证规律进餐，不饥一顿饱一顿，避免食用过多油腻、刺激性食物等。
二、若因暴饮暴食等不良习惯使胃黏膜屏障作用受损，诱发胃炎、胃溃疡等疾病，此时胃肠功能紊乱病情较重，出现消化不良、食欲不振等症状，通常难以自愈。患者需遵医嘱针对病因进行专业治疗，只有积极治疗原发病后，胃肠功能紊乱才可能消退。比如，对于胃炎患者，医生可能会使用抑制胃酸分泌的药物、保护胃黏膜的药物等进行治疗；对于胃溃疡患者，除了药物治疗，可能还需要注意饮食调理等。
日常应养成良好生活习惯，不抽烟、喝酒，不吃辛辣、刺激食物如芥末、生姜、辣椒等。若腹部出现不适症状，要及时到消化科就医，在医生建议下对症治疗，以免耽误病情。
总之，对于胃肠功能紊乱，要根据具体情况判断是否能自愈，同时要养成良好生活习惯，出现不适及时就医治疗。