尖锐湿疣的治疗难易程度与治疗目的相关。若以实现临床治愈，也就是去除疣体、缓解症状为目标，相对较容易治疗；但要是以彻底治愈，即清除HPV病毒、根治尖锐湿疣为方向，则较为困难。
一、临床治愈：
1.若仅将消除疣体和症状当作治疗目的，通常是比较容易实现的。临床上存在多种治疗手段，可根据医嘱联合运用以提升疗效。对于尖锐湿疣，可采取如激光、微波、电灼烧、光动力疗法等物理方式来去除疣体。
2.还能运用局部药物进行治疗，例如咪喹莫特乳膏、重组人干扰素α2b凝胶、酞丁安搽剂等。
3.对于体积较大的疣体，也可通过外科手术等办法去除。在疣体去除后，若6至9个月没有出现复发，即可视为临床治愈。
二、彻底治愈：
1.倘若想要彻底清除HPV病毒以达成根治尖锐湿疣的目的，往往会比较艰难。当前并没有专门针对HPV病毒的特效药物，治疗药物多数也是以局部用药为主。
2.也可以通过系统用药联合外用药物进行治疗，但这也仅仅只是能使病毒载量低于参考下限，而并非是完全根除。
3.当人体免疫力下降时，病毒有再次增殖从而导致复发的可能。
总之，尖锐湿疣的治疗效果取决于治疗目的，临床治愈相对容易实现，而彻底治愈则存在较大难度，且容易受多种因素影响而出现复发情况。