单侧巧囊即单侧卵巢巧克力囊肿，其有可能对怀孕造成影响，不过通过积极医治是能够自然怀孕的，通常不会引发不孕。单侧卵巢巧克力囊肿是因子宫内膜异位至卵巢而形成的，它会改变盆腔的内外部环境以及输卵管的走向，对正常排卵产生干扰，致使输卵管堵塞以及盆腔粘连等情况出现，进而对受孕产生不利影响。
一、如果单侧卵巢巧克力囊肿体积较小，且另一侧输卵管与卵巢都处于正常状态，那么是可以自然受孕的。此时可运用排卵试纸与B超来动态监测卵泡发育以及排卵的状况，随后安排同房，以此增加受孕的几率。
二、但要是单侧卵巢巧克力囊肿体积比较大，痛经症状显著，或者已经备孕6至12个月仍未能成功受孕，这种情况下可以考虑通过腹腔镜手术切除局部病灶。在治疗好转后可考虑备孕，并要定期进行复查。
三、而对于本身就存在不孕症且常规治疗难以治愈的情况，可考虑采用辅助生殖技术进行治疗，例如体外受精-胚胎移植等。
总之，单侧巧囊会对怀孕有一定影响，但可根据具体情况选择合适的治疗和备孕方式。