补牙三年后牙疼可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.龋齿复发：补牙后，牙齿可能再次发生龋齿，导致牙疼。这可能是由于补牙材料周围的牙齿组织继续受到细菌侵蚀，或者口腔卫生不良导致的。
2.牙髓炎或根尖周炎：如果龋齿没有及时治疗，细菌可能感染牙髓，引起牙髓炎。如果牙髓炎进一步发展，可能会导致根尖周炎。这两种情况都需要根管治疗来解决。
3.牙齿损伤：补牙后的牙齿可能在咀嚼过程中受到外力损伤，导致牙齿破裂、裂纹或牙根受损，从而引起牙疼。
4.牙周炎：牙周炎是一种牙龈疾病，如果不及时治疗，可能会导致牙齿松动和疼痛。
5.其他问题：例如智齿生长、牙龈发炎、颞下颌关节紊乱等也可能引起牙疼。
鉴于牙疼可能是严重问题的信号，建议采取以下步骤：
1.尽快就医：咨询牙医进行详细的口腔检查和诊断。牙医可以通过X光、探针等工具确定牙疼的原因，并制定相应的治疗计划。
2.遵循牙医建议：根据诊断结果，牙医可能会建议进行以下治疗措施：
龋齿治疗：如果是龋齿复发，可能需要重新补牙或进行更复杂的治疗，如根管治疗。
修复牙齿损伤：如果是牙齿损伤，可能需要进行修复或拔牙。
牙周治疗：如果是牙周炎，需要进行牙周清洁和治疗。
其他治疗：根据具体情况，可能还需要开具止痛药、消炎药或进行其他治疗。
3.注意口腔卫生：保持良好的口腔卫生对于预防牙齿问题非常重要。每天刷牙两次，使用牙线和漱口水，定期洗牙。
4.避免刺激性食物：避免食用辛辣、酸性、坚硬或过热的食物，以免加重牙疼。
5.定期复诊：按照牙医的建议定期进行复诊，以确保牙齿健康。
需要注意的是，每个人的情况都不同，治疗方案应根据具体情况而定。如果牙疼严重或持续不缓解，应尽快就医，以便及时解决问题。此外，如果补牙后出现任何异常情况，如补牙材料脱落、牙齿变色或疼痛加剧等，也应及时复诊。