男性小便时尿道疼可能由饮食辛辣、软组织损伤、上火、尿道炎、肾结石等因素引起，应针对性进行治疗。
一、饮食辛辣：若男性近期护理不当，饮食过于辛辣刺激，可能导致尿道黏膜受损，从而出现刺激性疼痛症状。此时患者需要做好护理，保持饮食清淡，适当多食用新鲜的水果和蔬菜，通常能缓解症状。
二、软组织损伤：若男性患处近期遭受外力碰撞或过度摩擦，受外力影响可能使尿道黏膜出现充血、水肿现象，进而引发疼痛。建议患者适当进行按摩、湿敷，这有助于改善血液循环，促进病情缓解。
三、上火：上火一般指人体阴阳失衡后出现的内热证候。若男性合并上火，可能因内火积聚而出现口苦、头晕、尿痛等症状。男性患者可在医生指导下使用牛黄清胃丸、清热解毒口服液、金银花颗粒等药物来清除内火。
四、尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症性感染。由于炎症刺激，会出现尿痛、尿频、尿急等现象，可能还伴有发热症状。男性患者可在医生指导下使用头孢克洛颗粒、盐酸米诺环素片、左氧氟沙星片等药物进行治疗。
五、肾结石：肾结石通常是指体内部分成分在肾脏中形成结石，导致男性患者出现一系列以泌尿系统症状为主的疾病。可能因结石影响使局部软组织受损，常出现尿痛现象，严重时还可能出现血尿症状。男性患者可在医生指导下使用金钱草颗粒、排石颗粒、尿石通丸等药物控制病情，必要时可采取体外超声波碎石术促进结石排出。
该症状病因较为复杂，需及时就医治疗，以免病情进一步加重。