导致睡了一觉起来头疼的原因众多。常见原因有：睡眠环境差致睡眠质量欠佳，或睡眠时间过长、过短，以及睡眠姿势不佳等，都可能引发头疼。此外，一些病理性因素也会造成睡后头疼：
一、颈椎病：若既往有颈椎病病史，睡眠姿势不当使颈椎病症状加重，压迫周围神经根，刺激或牵拉头部痛觉敏感组织，可致头疼。
二、高血压：高血压患者晨起时血压往往较高，血压升高时就可能出现睡后头疼现象。
三、感冒：睡眠时受凉或吹风，可能引起感冒发热，致使患者醒来后有头疼，还可能伴有肌肉酸痛、乏力、流涕等表现。
四、睡眠呼吸暂停综合征：部分患者存在严重的睡眠呼吸暂停综合征，导致缺氧、二氧化碳潴留，这也会诱发头疼症状，头疼可出现在晨醒时，严重的还可发生于夜间熟睡时导致患者觉醒。
五、睡眠性头痛：头疼的发生与睡眠有关，发生于睡眠中或醒后，可能与生物钟紊乱有关，多发生在50岁以上人群，较为少见，若患此病，发作较频繁，每月可发生15次以上，属于原发性头疼。
六、部分脑血管疾病：如脑梗死、脑出血等，既往患有高血压、糖尿病、高血脂、动脉粥样硬化病史的人群，若睡后头疼，并伴有肢体麻木、偏瘫、吐词不清、口角歪斜等症状，需警惕这类疾病，一般好发于中老年。
所以，若睡后头疼持续不缓解或症状加重，并伴有其他不适，建议及时就医，必要时进行CT检查。