肛周脓肿是肛管直肠周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，一旦确诊，需及时治疗。治疗方法主要有非手术治疗和手术治疗等。
非手术治疗方式
药物治疗：
抗生素治疗： 可选用对革兰阴性杆菌有效的抗生素，如头孢类抗生素等，通过抑制细菌细胞壁合成来发挥杀菌作用，能控制感染，缓解炎症。一般需要根据病情轻重决定用药疗程，可能需持续用药数天。局部坐浴： 可用1:5000高锰酸钾溶液坐浴，每天2 - 3次，每次20 - 30分钟。高锰酸钾溶液有消毒、消肿、止痛的作用，能清洁肛周局部，促进血液循环，减轻炎症反应。
手术治疗方式
脓肿切开引流术：
这是治疗肛周脓肿最常用的方法。在脓肿波动最明显的部位切开，使脓液充分引流出来。手术一般在局部麻醉下进行，操作相对简单，能快速缓解疼痛和炎症，但单纯切开引流容易形成肛瘘，约有1/3 - 1/2的患者会发展为肛瘘。
一次性根治术：
对于低位单纯性肛周脓肿，可采用一次性根治术。手术直接找到内口，将脓肿及内口一并处理，避免了二次手术的痛苦。该手术要求医生对肛周解剖结构熟悉，能准确找到内口，手术效果相对较好，复发率较低。
挂线疗法：
适用于高位肛周脓肿或复杂性肛周脓肿。利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械压迫作用，缓慢切开肛瘘，同时避免了肛门括约肌一次性断裂引起的肛门失禁。挂线过程中患者痛苦相对较小，需要定期收紧药线，一般需要1 - 2周时间完成挂线过程。肛周脓肿一旦确诊应尽早治疗，非手术治疗适用于脓肿初期、症状较轻的患者，但多数情况下需要手术治疗。手术方式的选择需根据脓肿的位置、大小、复杂程度等因素综合判断。患者在治疗后要注意保持肛周清洁，便后坐浴，避免食用辛辣刺激性食物，以促进伤口愈合，减少复发的可能。