口腔溃疡的引发原因有多种。一般来说，大约有20% - 30%的口腔溃疡是由遗传因素导致的，如果父母双方都有复发性口腔溃疡，子女发病概率会明显增高。
局部创伤因素
口腔内机械性损伤： 比如刷牙时用力过猛，不小心划伤口腔黏膜；或者吃了比较硬的食物，像坚果、脆骨等，刮伤了口腔组织，就容易引发口腔溃疡。这种情况在日常生活中比较常见，尤其是那些刷牙方式不正确或者进食习惯不好的人更容易出现。假牙不合适： 如果佩戴的假牙不合适，长时间摩擦口腔黏膜，也会导致口腔溃疡。例如假牙边缘过于尖锐，不断刺激口腔内的软组织，就会使局部黏膜受损，进而引发溃疡。
营养不良因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B1、B2、B6以及维生素C时，容易出现口腔溃疡。比如长期挑食、偏食的人，很容易造成这些维生素摄入不足。研究发现，维生素B族参与人体多种代谢过程，缺乏时会影响黏膜的正常修复；维生素C能促进胶原蛋白合成，缺乏时也会影响口腔黏膜的健康。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌是人体多种酶的组成成分，参与细胞的生长和代谢，缺乏锌会影响伤口愈合；铁是血红蛋白的组成成分，缺铁会导致免疫力下降，容易引发口腔黏膜的炎症反应，从而导致口腔溃疡。
免疫系统因素
自身免疫反应异常： 当人体免疫系统出现异常时，会错误地攻击自身的口腔黏膜组织，引发口腔溃疡。比如患有白塞病的患者，免疫系统紊乱，就会反复出现口腔溃疡，同时还可能伴有眼部病变、生殖器溃疡等症状。这种情况相对较为复杂，需要专业的医疗检查来确诊。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如过度疲劳、患有某些慢性疾病（如糖尿病、结核病等）时，容易受到病原体的侵袭，口腔内的菌群平衡被打破，从而引发口腔溃疡。例如长期熬夜的人，身体免疫力下降，就比作息规律的人更容易长口腔溃疡。