停胎，即胚胎停育，导致其发生的原因较多。据统计，胚胎染色体异常是早期胚胎停育最常见的原因，约占50%~60%。
染色体因素：
胚胎自身染色体问题： 胚胎在发育过程中，染色体发生数目或结构的异常，就可能出现停胎。比如常染色体三体、X单体等染色体数目异常，或者染色体缺失、易位等结构异常，都会影响胚胎正常发育。父母染色体异常： 若父母双方有一方染色体存在平衡易位等情况，也可能遗传给胚胎，从而引发停胎。
母体因素：
内分泌失调： 女性体内的激素水平对胚胎着床和发育至关重要。例如，黄体功能不全，会使得孕激素分泌不足，无法为胚胎发育提供良好的内分泌环境，增加停胎风险；甲状腺功能异常，无论是甲状腺功能减退还是亢进，都可能干扰胚胎的正常发育进程。一般来说，甲状腺功能减退患者体内甲状腺素分泌不足，会影响胚胎的代谢等多种生理过程；而甲状腺功能亢进时，过高的甲状腺素水平也会对胚胎产生不良影响。全身性疾病： 孕妇患有一些严重的全身性疾病，如严重的糖尿病未控制好、高血压、心脏病心功能不全等，会使得机体内环境不利于胚胎生存，导致停胎。比如糖尿病患者血糖长期居高不下，会影响胎盘的血液供应等，进而影响胚胎发育。
子宫因素：
子宫解剖结构异常： 子宫畸形，像纵隔子宫、单角子宫等，会影响胚胎着床和发育空间；子宫肌瘤，尤其是黏膜下子宫肌瘤，会占据宫腔空间，影响胚胎着床，还可能影响胎盘血供；宫腔粘连也会对胚胎着床造成阻碍，使得胚胎无法正常生长发育。子宫内膜病变： 子宫内膜炎会影响子宫内膜的容受性，使得胚胎难以着床；子宫内膜过薄，不足以支持胚胎着床和发育，也容易导致停胎。一般来说，子宫内膜厚度低于8毫米可能就会有一定影响。
免疫因素：
自身免疫异常： 孕妇自身存在抗磷脂综合征等自身免疫性疾病时，体内会产生多种自身抗体，这些抗体可攻击胎盘滋养细胞，影响胎盘血管的形成和血流灌注，从而导致胚胎停育。同种免疫异常： 母体对胚胎免疫耐受失败，也会引发排斥反应，使得胚胎被母体免疫系统攻击，造成停胎。比如封闭抗体缺乏等情况，就可能导致这种同种免疫异常。