氢氯吡格雷是常用的抗血小板聚集药物，但也有一些副作用。一般来说，大约有2% - 5%的患者可能会出现一些常见的副作用。
胃肠道方面的副作用
胃肠道不适： 部分患者服用氢氯吡格雷后会出现胃肠道反应，比如腹痛、腹泻。有研究显示，约1% - 3%的患者会出现较为明显的腹痛症状，表现为腹部隐痛或者钝痛，可能持续一段时间。恶心呕吐： 还有些人会出现恶心的感觉，严重时可能伴随呕吐，大概有0.5% - 2%的患者会发生这种情况，影响患者的进食和日常生活。
出血相关的副作用
皮肤黏膜出血： 可能会出现皮肤瘀斑，这是比较常见的出血表现，一般是因为皮下小血管出血导致，大概有1% - 4%的患者会出现这种情况。另外，还可能有鼻衄，也就是鼻出血，大约0.5% - 2%的患者会发生。消化道出血： 严重的情况下可能引发消化道出血，表现为黑便或者呕血，虽然发生概率相对较低，约0.1% - 1%，但一旦出现需引起重视，因为可能导致贫血等更严重问题。
血液系统方面的副作用
血小板减少： 少数患者服用氢氯吡格雷后可能出现血小板减少的情况，血常规检查会发现血小板计数降低，大概有0.1% - 0.5%的患者会出现这种血液系统的异常变化，血小板减少可能会增加出血的风险。白细胞减少： 个别患者还可能出现白细胞减少，不过发生概率较低，约0.05% - 0.2%，白细胞减少会使机体抵抗力下降，容易发生感染等问题。
其他可能的副作用
过敏反应： 极个别患者会出现过敏反应，表现为皮疹、瘙痒等，发生概率非常低，约0.01% - 0.05%，如果出现过敏症状需立即停药并就医。肝功能异常： 少数患者服用后可能出现肝功能指标异常，如转氨酶升高等，但发生概率不高，约0.05% - 0.3%，需要定期监测肝功能。