脑梗死的治疗中，常用的有效药物有溶栓药物、抗血小板聚集药物和神经保护类药物等。一般来说，发病4.5小时内符合条件的患者可使用阿替普酶等溶栓药物，能有效改善预后。
溶栓类药物
阿替普酶： 属于重组组织型纤溶酶原激活剂，能特异性地激活血栓中的纤溶酶原，转化为纤溶酶，溶解血栓。一般在脑梗死发病4.5小时内使用效果较好，可显著降低患者致残率和死亡率，但使用前需严格评估患者的适应证和禁忌证。尿激酶： 也是常用的溶栓药物，通过激活内源性纤溶系统，使纤维蛋白溶酶原转变为纤溶酶，从而溶解血栓。通常在发病6小时内可考虑使用，不过其出血风险相对阿替普酶可能稍高一些。
抗血小板聚集药物
阿司匹林： 通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2的生成，从而抑制血小板聚集。一般建议脑梗死患者长期小剂量服用，能降低复发风险，但部分患者可能会出现胃肠道不适等不良反应，如恶心、呕吐等。氯吡格雷： 作用机制是选择性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合及继发的ADP介导的糖蛋白GPⅡb/Ⅲa复合物的活化，从而抑制血小板聚集。对于不能耐受阿司匹林或存在阿司匹林抵抗的患者可选用，同样也有出血等不良反应的可能。
神经保护类药物
依达拉奉： 具有清除自由基、抑制脂质过氧化的作用，能减轻脑梗死引起的神经细胞损伤。可改善急性脑梗死患者的神经功能缺损状况，一般通过静脉滴注给药，使用过程中需密切监测肾功能等指标。胞磷胆碱钠： 可以改善脑代谢，促进大脑功能恢复，通过增强脑干网状结构上行激活系统的功能，促进苏醒，还能改善大脑循环。常用于脑梗死的辅助治疗，不良反应相对较少，但也需在医生指导下合理使用。