避孕药可能带来一些危害，比如短效口服避孕药，部分人服用后可能在最初几个月出现类早孕反应，像恶心、呕吐、头晕等，发生率大概在10%左右。
对月经的影响
经期紊乱： 有些女性服用避孕药后会出现月经周期改变，可能月经提前或者推迟。比如部分短效避孕药使用者，约有5% - 10%会出现月经周期缩短或者延长的情况。经量变化： 还可能出现经量减少，甚至有些女性会出现闭经，不过这种情况相对较少见，大约占1% - 2%。
对体重的影响
体重增加风险： 部分人服用避孕药后可能会有体重增加的情况。这是因为避孕药中的某些成分可能会导致水钠潴留，一般来说，大约有3% - 5%的女性会出现这种体重轻度增加的现象，但也不是所有服用者都会出现。代谢变化： 长期服用可能会对脂肪代谢有一定影响，不过具体机制还在研究中，但有部分女性会察觉到体重有变化。
对健康的潜在长期影响
心血管风险： 有研究表明，长期服用某些含有较高剂量雌激素的避孕药，可能会轻微增加静脉血栓的风险，虽然总体风险不高，但对于有吸烟习惯、年龄较大（35岁以上）或者有心血管疾病家族史的女性来说，风险相对会有所升高。癌症风险： 目前有研究显示，长期服用避孕药可能对某些癌症的发生有一定影响，比如长期服用避孕药8年以上的女性，患乳腺癌的风险可能会有轻度增加，但这也不是绝对的，只是有相关研究发现的一种趋势。