2岁宝宝发烧39度，最佳处理方式为先立即服用退烧药，如口服美林或泰诺林，同时进行物理降温，随后就医。喂退烧药后，要让宝宝多喝温水，穿着宽松纯棉质衣服以利出汗散热退烧；可同步采用物理降温辅助，如贴降温贴、温水擦浴或温水澡等，还可给宝宝服用清热解毒类中成药退烧，如羚羊角颗粒或小儿牛黄清心散等。鉴于宝宝2岁且39度属高烧，多为感染性疾病，所以需到医院看儿科急诊评估感染状态。若宝宝反复发烧超两天，建议查血常规、C反应蛋白，检查咽部是否发炎，听诊肺部并检查肺片，依检查结果对症治疗。
一、立即服用退烧药：
1.可以选择口服美林或者泰诺林等儿童常用的退烧药。
二、进行物理降温：
1.让宝宝多喝温水，有助于补充水分和促进散热。
2.给宝宝穿上相对宽松、纯棉质的衣服，这样有利于宝宝出汗和散热退烧。
三、物理降温辅助办法：
1.贴降温贴，能够起到一定的降温作用。
2.进行温水擦浴，用温水擦拭宝宝身体。
3.洗个温水澡，帮助宝宝降低体温。
四、服用清热解毒类中成药：
1.如羚羊角颗粒，有退烧的功效。
2.小儿牛黄清心散等也可用于辅助退烧。
五、就医治疗：
1.由于宝宝2岁且39度为高烧，通常是感染性疾病，所以要到医院看儿科急诊。
2.评估宝宝的感染状态，包括检查身体各项指标等。
六、后续检查：
1.若宝宝反复发烧超过两天，建议进行相关检查。
2.查血常规和C反应蛋白，了解身体的炎症情况。
3.检查咽部是否有发炎，判断是否有呼吸道感染。
4.听诊肺部，检查肺片，查看肺部是否有异常。
总结：对于2岁宝宝发烧39度的情况，要及时采取退烧药、物理降温、服用中成药等措施，并尽快就医评估感染状态，后续根据发烧情况进行相关检查以明确原因并对症治疗。