甲沟炎最有效的治疗方法需根据病情轻重来定。早期症状较轻的甲沟炎，通过一般处理有恢复的可能，若病情较重可能需要药物或手术干预。
早期轻症的处理
保持局部清洁： 发现甲沟炎后，首先要保持脚趾或手指的局部清洁。可以用温水和温和的肥皂清洗患处，每天清洗1 - 2次，清洗后用干净的毛巾轻轻擦干。比如每天用37℃ - 40℃的温水浸泡患部，每次15 - 20分钟，能促进局部血液循环，缓解不适。涂抹药物： 对于轻度炎症，可在医生指导下涂抹一些抗菌药膏，像莫匹罗星软膏等，这类药膏能抑制细菌生长，减轻炎症反应。一般连续涂抹几天，炎症可能会逐渐消退。
药物治疗情况
外用抗生素： 除了莫匹罗星软膏，还有夫西地酸乳膏也可用于甲沟炎的治疗。夫西地酸乳膏对引起甲沟炎常见的金黄色葡萄球菌等有较好的抗菌作用，涂抹时要均匀覆盖患处。口服抗生素： 如果炎症比较明显，局部处理配合口服抗生素可能效果更好。比如口服头孢类抗生素，不过要注意对头孢过敏的人不能用。一般口服3 - 5天，需遵医嘱服用，不能自行随意停药。
手术治疗情况
切开引流： 当甲沟炎发展到形成脓肿时，就需要进行切开引流手术。医生会在脓肿处做一个小切口，将脓液引流出来，术后要定期换药，一般换药间隔为1 - 2天，直到伤口逐渐愈合。通常手术后1 - 2周伤口能基本恢复。拔甲术： 如果甲沟炎反复发作，或者感染累及甲床，可能需要做拔甲术。拔甲后要注意保护伤口，避免沾水，防止再次感染。一般拔甲后新的指甲会在1 - 3个月左右逐渐生长出来。