性交后小肚子疼可能由多种原因引起。一般来说，大约有以下几类常见情况。
生理性因素导致
肌肉痉挛：
激烈运动引发：性生活时动作过于剧烈、幅度较大，可能导致盆腔部位的肌肉发生痉挛性收缩，从而引起肚子疼，这种情况通常休息一段时间就能缓解。比如一些比较激烈、频繁的性生活动作，就容易出现这种肌肉痉挛导致的疼痛。姿势不当影响：不合适的性交姿势可能会对盆腔内的器官产生过度压迫或牵拉，也会引起肚子疼。例如某些比较特殊、不常见的姿势，如果双方配合不好，就可能出现这种情况。
病理性因素导致
妇科炎症方面
盆腔炎：女性本身有盆腔炎的话，性生活会刺激炎症部位，导致肚子疼。盆腔炎患者除了性交后肚子疼，平时可能也会有下腹部坠胀、疼痛等表现，而且可能伴有白带增多等症状。宫颈炎：宫颈有炎症时，性生活的刺激会使宫颈受到触碰，引发疼痛。宫颈炎患者可能出现白带异常，如白带发黄、有异味等情况，性交后肚子疼会比较明显。
泌尿系统问题
膀胱炎：如果本身有膀胱炎，性生活过程中可能会刺激膀胱，引起小肚子疼痛。膀胱炎患者除了性交后肚子疼，还可能有尿频、尿急、尿痛等症状，比如总是频繁想上厕所，排尿时尿道有灼热感等。
其他情况
黄体破裂：
在排卵期后期形成黄体，如果性生活时力度较大，可能导致黄体破裂，引起突然的小肚子疼痛，这种疼痛有时比较剧烈，还可能伴有阴道出血等情况，多见于月经周期后半期的女性。
肠道问题：
本身有肠道疾病，如肠易激综合征等，性生活时的刺激可能诱发肠道痉挛，导致小肚子疼痛。比如本身肠道比较敏感的人，在性生活后就可能出现这种因肠道问题引起的肚子疼。