牙根发黑腐烂主要有以下两种治疗方式：
一、根管治疗：首先要经拍口腔X线片检查，如果只是轻度腐烂，牙根整体结构依然存在，牙齿也无明显松动且还能发挥作用，那么就需要在专业医生操作下，清理腐烂牙根里的腐烂牙组织，这样能阻断口腔细菌滋生环境，接着进行根管治疗，以避免感染进一步扩散从而损坏整个牙根。在治疗结束后，还可进行桩冠修复。
二、拔除牙根：若牙根腐烂严重，牙根整体结构已基本消失，完全无法保留和发挥其功能，此时则需要在局麻药物作用下进行拔除处理。拔除后的创面通常需要2至3个月才能恢复正常，待恢复正常后，要结合患者身体状况以及牙槽骨骨量情况，选择种植牙或者镶牙来填补空缺。总之，牙根发黑腐烂需前往医院就诊，严格遵循医嘱完善相关检查并进行治疗。
总结概况提示：文章阐述了牙根发黑腐烂的两种治疗方式，包括根管治疗和拔除牙根，分别说明了各自适用的情况和具体操作步骤，强调了患者应及时就医并遵医嘱治疗。